1、可以直接使用抽水管对滤棉反冲洗。但是在清洗的时候一定要注意，不可搓洗，也不能必须清洗的完全干净，也不能直接使用自来水进行清洗。
2、在清洗过滤网的时候，每次只能清洗1/2~1/3滤棉，不可一次全洗。否则的话，附着在滤棉上的硝化细菌，就会被彻底消灭，导致失去生物过滤的作用。
3、如果过滤网的过滤棉过于贴紧过滤合底的话应该正确使用栅格板，以保证透过滤棉的清水能顺利进入缸内。如果没有栅格板的话，也可以买些陶瓷环或陶粒放入滤合，不仅可以架空滤棉，而且还可以增加硝化细菌的附着面积，提高过滤网的生物过滤效能。