1、化学消毒。主要是利用一些消毒剂对汽车部件进行喷酒和擦拭，通过化学作用达到出去病菌的目的，这种杀菌方法操作简单易行，病菌杀灭比较彻底。目前市场上常见的化学消毒液主要有过氧乙酸和84消毒液。该方法消毒较彻底，但是消毒后车舱内会留有气味，需要开窗通风一段时间。
2、臭氧消毒。利用一个能迅速产生大量臭氧的汽车专用消毒机来消毒。臭氧是一种高效广谱快速的杀菌剂，可以杀灭多种病菌和微生物，当其达到规定浓度后，消毒杀菌可以迅速完成。
3、蒸汽消毒。蒸汽消毒是比较传统的汽车空气清洁方法，做法是：先用普通清洁剂对车辆进行清洁，并用保护剂或干洗护理擦拭，清洁车室、地毯、脚垫、座套，然后再车内喷清洁剂、杀菌剂，最后用高温蒸汽进行消毒。杀菌剂内部含有能产生分解臭源的酶，从而能清除异味和细菌的滋生。
4、离子消毒。主要是通过购买车载氧吧释放离子达到车内空气清新的目的，他只是一种清新和净化空气的方式，优点是使用简单。
5、光触媒消毒。二氧化钛是一种光催化剂，它见光后可以产生正负电子，其中正电子与空气中的水分子结合产生具有氧化分解能力的氢氧自由基，而负电子则与空气中的氧结合成活性氧。氢氧自由基和活性氧均具有强有效杀菌能力，对于车内常见的甲醛、氨和苯等化合物具有分解作用，同时还可以清除车内的漂浮细菌。二氧化钛可以被一种特殊的树脂固定在车内，所以消毒效果持久，一般进行一次可以保持功效2年左右，费用较低。